Kurs odbywać się będzie w formie stacjonarnej.

Cele kursu

Celem kursu jest przekazanie wiedzy dotyczącej markerów molekularnych stosowanych w badaniach populacyjnych, filogenetycznych, medycynie i diagnostyce medycznej oraz kryminalistyce. Kurs umożliwi naukę wybranych technik laboratoryjnych do uzyskiwania danych i metod ich analizy, a także interpretację rezultatów. W prosty i przystępny sposób zostaną również przedstawione zagadnienia związane z analizą mikrobiomów, w oparciu o sekwencjonowanie DNA metodami nowej generacji.

Tematyka kursu

W ramach kursu zostaną przedstawione następujące zagadnienia:

• Oczyszczanie DNA metodą kolumienkową i spektrofotometryczny pomiar stężenia DNA
• Analiza markerów STR (sekwencje mikrosatelitarne) – profil genetyczny
• Amplifikacja sekwencji barkodowych DNA
• Identyfikacja markerów SNP metodą wydłużania startera (SNaPshot)
• Sekwencjonowanie DNA metodą Sangera
• Bioinformatyczna analiza wyników

Efekty uczenia się

Uczestnik po zakończeniu zajęć potrafi:

• Wyizolować DNA z różnego typu materiału biologicznego
• Scharakteryzować wyizolowany DNA pod względem jakościowym i ilościowym posługując się technikami spektrofotometrycznymi
• Zaprojektować startery do reakcji PCR
• Wymienić i scharakteryzować różne typy markerów molekularnych pod kątem ich informatywności i ekonomiki zastosowania
• Dobrać i zastosować odpowiednie markery oparte o sekwencje DNA do rozwiązania określonego problemu biologicznego
• Wykonać wybrane techniki laboratoryjne związane z analizą markerów SNP, STR i sekwencji DNA

Metody pracy

Wstęp teoretyczny (ok. 30 min; wykład z prezentacją multimedialną wybranych zagadnień) oraz ćwiczenia praktyczne (ok. 3h; zajęcia laboratoryjne).